Хирургическая стоматология занимается удалением зубов различной сложности, хирургическим лечением таких осложнений как корневая киста, гранулема или абсцесс, удалением новообразований ротовой полости, коррекцией врожденной патологии и приобретенных дефектов зубочелюстной системы. Самостоятельными направлениями являются челюстно-лицевая хирургия, хирургия слюнных желез. С развитием имплантации зубов распространенными стали остеопластические операции по наращиванию костной ткани под имплантат.